邛崃市疾病预防控制中心成立于 2002 年11月，是政府举办的集疾病防治、公共卫生技术管理、健康教育和健康促进于一体的公益一类卫生事业单位。现占地11.4亩，建筑面积5117平方米，疾控中心下设6个科室：办公室、传染病防制和免疫规划科、寄生虫和地方病防制科、慢性病防制和健康教育科、艾滋病和性病防制科、卫生检验监测科。中心核定编制92人，现有在职职工74人，其中卫生专业技术人员59人，高级职称7 人，中级职称20人。

2017年中心实验室通过省级计量认证，2018成功创建二级甲等疾控中心、省级慢性病综合防治示范区、巩固了脊灰、碘缺乏病、疟疾消除成果，2019年实现血吸虫病消除达标，传染病防治工作多次获得成都市先进单位。2020年1月28日在成都市区县率先启动新冠肺炎核酸检测，连续10年无甲类传染病和突发公共卫生事件发生，确保了全市公共卫生安全。

2020年被成都市评为新冠肺炎疫疫情防控“工人先锋号”；2021年卫生健康工作先进集体。